迷宮I

まずはひたすら上へ登っていく。最上部の機械で扉を開け、先へ。

• 途中、ライフカプセル入手可能（HP+5、最大HP41）。

迷宮H

一本道なので、移動するブロックに挟まれないように注意しながら進む。

迷宮W

右へ進み「キャンプ」へ。中にいるドクター下呂に話しかけ、診療所のカギを入手。

• 道中の「迷宮の店」の会話イベントで「はい」を選択すると、ポーラスターとファイアボールをスネークに融合してもらえる。
  「砂区」でポーラスターをマシンガンと交換していた場合は、ターボチャージを入手。
• 「キャンプ」入り口上方にある隠し通路奥の扉の先にある宝箱から、アームズバリアを入手可能。
  マシンガンレベル3か、ブースター（後に入手）が必要。どちらも無ければ近くにいるクリッターに接触した反動でもOK。
  

診療所のカギを使って「診療所跡」へ。宝箱から万能薬入手直後、プー・ブラック戦。 「キャンプ」に戻りドクター下呂に万能薬を渡す。このときカーリーに話しかけ、大石の部屋の話を聞いておく。
迷宮を奥へ進み、モンスターX戦。 撃破後右にある扉へ。

迷宮B

上からブースター博士が落ちてくるので、話しかけるとブースターv0.8入手可能（足元の赤い印のところで上手くジャンプすれば飛び越えられるため、無視していくこともできる）。右の扉から「大石の塞ぐ所」へ。

• 【トゥルーエンド分岐】トゥルーエンドを見たければ、ブースター博士を無視し右の扉へ。

「大石の塞ぐ所」でカーリーと会話。大石の左端を調べるとイベント後、バルログ戦。

• バルログ撃破後の宝箱でミサイル砲をスーパーミサイルに強化可能。ミサイル砲未所持の場合は開かない。

迷宮M

このマップではカーリーと共に行動。途中の転送装置から「迷宮の店」へ戻ることができる。
最奥の扉から「暗い所」を経由して「コア」へ。

コア

上段の機械を操作してシャッターを開ける。シャッター NO.4は何度か攻撃すれば開く。
シャッター NO.4が開いたらもう一度機械を操作してリフトを降ろし、下段奥の機械で最後のシャッターを開ける。
カーリーに話しかけるとコア戦。途中からカーリーも攻撃に参加する。 コア撃破後に息が出来ないのはイベントなので焦らずに。このときカーリーのボンベを入手し、以降は水中で溺死しなくなる。イベント終了後、「暗い所」の真ん中の獅子の口から「水路」へ。

• 【トゥルーエンド分岐】トゥルーエンドを見たければ、コア戦後にカーリーを救い出す必要がある。コア撃破直後（くうきが減るイベント中）、右下の光っている所からけん引ロープを入手し、イベント終了後にカーリーを調べて牽引する。戦闘中・イベント終了後は入手できないので、コア戦前に入手しておくのが無難。
  

水路

「水路」最奥の「大動脈」でアイロンヘッド戦。 アイロンヘッド撃破後、「ミミガーの村」の「貯水池」に辿りつく。

• 「水路」上段の突き当りまで進んで左斜めに降りる付近に、大量の隠しアイテム。一見何も無いように見えても、ヒットエフェクトが表示されるところを攻撃していたらハートが出現する。
  
• 【トゥルーエンド分岐】トゥルーエンドを見たければ、ヤブクラゲが大量にいる所の右上にある「水路の小部屋」へ。
  ここでベッド→PC→右の本棚→カーリー×3と調べて「いいえ」を選択し、水抜きと再牽引をする。アイロンヘッド撃破後、カーリーは流されていく。
• アイロンヘッドをノーダメージで撃破するとコレクターアイテム、異星人のメダルを入手。